Вопросы по теме 'awk'

Сохраняйте общие строки между двумя файлами, но включая дубликаты [дубликаты]
У меня есть два файла, которые выглядят так: Файл 1: rs1 rs2 rs3 Файл 2: rs14 G rs1 A rs1 G rs2 T rs3 T rs9 G Я хочу сохранить строки в файле 2, которые присутствуют в файле 1, но включая дубликаты. Итак, мой результат должен...
36 просмотров
schedule 09.04.2024

Извлечение шаблонов с помощью awk в скрипте bash
У меня есть этот файл с разделителями табуляции. Тест.txt chr1 10111412 apples chr2 195121230 pears chr2 991924122 elephants Если я хочу что-то в столбце 1 из chr2, awk '/chr2\t/ Test.txt Выход: chr2...
59 просмотров
schedule 13.03.2024

удалить избыточность в файле на основе двух полей, используя awk
Я пытаюсь удалить повторяющиеся строки в очень большом файле (~ 100 000 записей) в соответствии со значениями первых двух столбцов без учета их порядка, а затем распечатать эти поля + другие столбцы. Итак, из этого ввода: A B XX XX A C XX XX B...
518 просмотров
schedule 17.04.2024

awk транспонирует выбранные строки в столбцы
Имею текстовый файл в таком формате: [Term] id: HP:0000006 name: Autosomal dominant inheritance alt_id: HP:0001415 alt_id: HP:0001447 alt_id: HP:0001448 alt_id: HP:0001451 alt_id: HP:0001455 alt_id: HP:0001456 alt_id: HP:0001463 def: "A mode of...
63 просмотров
awk
schedule 25.04.2024